Life Science Knowledge Bank - ナレッジデータベース
創薬支援ナリッジソリューション
LSKBはクラウドベースの創薬のためのターゲット探索システムで、疾患からのターゲット探索を始め、化合物構造からのターゲット予測機能を持ち、ドラッグ・リパーパシングを始め、作用機序の解釈や毒性情報の参照などの機能を有しています。
文献の解釈にはAIを利用し疾患とターゲットの関係をグループ化して、さまざまな角度で既知情報から特徴を抽出しています。
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ターゲットやバイオマーカーの探索
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化合物からのターゲット予測
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ドラッグ・リパーパシング
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毒性や安全性情報の参照
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ワークフローツールで処理の自動化
製品カタログ
動作環境
クラウドシステム
FireFox
Google Chrom
Safari
ライセンス形態
年間ライセンス
詳細はお問合せください。
疾患から、ターゲット・バイオマーカー・候補治療薬を探索
Target Exploration
疾患から効率よくターゲットを探索
Biomarker Exploration
疾患からBiomarker候補遺伝子を探索
GO-MoA
疾患ターゲットと薬剤の生物学的機能を利用して疾患から新規化合物、新規ターゲットを探索
さまざまな手法で探索した結果の共通項を求めれるのが特徴です。
■ 化合物からターゲット予測
Target Prediction
化合物構造から構造類似性とアッセイデータを利用してターゲットを予測
Novel Target Estimation
by Protein Similarity
タンパク質の類似性を利用してターゲット候補範囲を広げて探索
加重平均によってターゲットを予測、さらにポケット類似性タンパク質を求め、範囲を広げて探索
■ ドラッグ・リパーパシング
Drug Repurposing
疾患や既存化合物から新しい候補を探索
(A) 構造からのターゲット予測と、タンパク質類似性により拡大し、新たな疾患のターゲットを探索するルート
(B) 疾患とその治療薬の生物学的機能を利用して新規ターゲットを探索するルート
さまざまな手法で探索した結果の共通点を求める
■ 毒性情報参照
Toxicity associated Targets
EvidenceとともにHepatotoxicityに関わるターゲットをリストアップした例
Liver toxicity/Adverse Event Information
RosiglitazoneのLiver toxicity表示例
■ 遺伝子発現実験から毒性表現型予測・作用機序予測
Expression Analysis
遺伝子発現解析により MoA(作用機序)や内在する毒性を示唆する
発生毒性に関するGSEAデータセットを持っていることが特徴。
その他、MoAなどのデータセットも準備している。
ゼブラフィッシュの発生毒性の予測例
■ 検索パイプライン構築ツール
Workflow
標準メニューにない探索パイプラインが構築可能。
目的とするデータ収集を可能にする自動化処理。
繰り返し誰でも使える定型化。
データのアップデート時も再実行で更新。
ElpisMapで描画
化合物の部分構造と、複数のターゲットタンパク質を指定し、公共データから化合物の活性値と分子量をもとに、意思決定を行うツールElpis Mapで表示するパイプラインの例