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Life Science Knowledge Bank -​ ナレッジデータベース

​創薬支援ナリッジソリューション

LSKBはクラウドベースの創薬のためのターゲット探索システムで、疾患からのターゲット探索を始め、化合物構造からのターゲット予測機能を持ち、ドラッグ・リパーパシングを始め、作用機序の解釈や毒性情報の参照などの機能を有しています。
文献の解釈にはAIを利用し疾患とターゲットの関係をグループ化して、さまざまな角度で既知情報から特徴を抽出しています。
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  • ターゲットやバイオマーカーの探索
  • 化合物からのターゲット予測
  • ドラッグ・リパーパシング
  • 毒性や安全性情報の参照
  • ​ワークフローツールで処理の自動化
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製品カタログ
LSKBナレッジソリューションパンフレット
​動作環境

クラウドシステム

FireFox

Google Chrom

Safari

ライセンス形態

年間ライセンス

​詳細はお問合せください。

疾患から、ターゲット・バイオマーカー・候補治療薬を探索
Target Exploration

疾患から効率よくターゲットを探索

Biomarker Exploration

疾患からBiomarker候補遺伝子を探索

GO-MoA

疾患ターゲットと薬剤の生物学的機能を利用して疾患から新規化合物、新規ターゲットを探索

さまざまな手法で探索した結果の共通項を求めれるのが特徴です。

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■ 化合物からターゲット予測
Target Prediction

化合物構造から構造類似性とアッセイデータを利用してターゲットを予測

Novel Target Estimation
by Protein Similarity

タンパク質の類似性を利用してターゲット候補範囲を広げて探索

加重平均によってターゲットを予測、さらにポケット類似性タンパク質を求め、範囲を広げて探索

■ ドラッグ・リパーパシング
Drug Repurposing

疾患や既存化合物から新しい候補を探索

(A) 構造からのターゲット予測と、タンパク質類似性により拡大し、新たな疾患のターゲットを探索するルート

(B) 疾患とその治療薬の生物学的機能を利用して新規ターゲットを探索するルート

さまざまな手法で探索した結果の共通点を求める

■ 毒性情報参照

Toxicity associated Targets

EvidenceとともにHepatotoxicityに関わるターゲットをリストアップした例

Liver toxicity/Adverse Event Information

RosiglitazoneのLiver toxicity表示例

■ 遺伝子発現実験から毒性表現型予測・作用機序予測
Expression Analysis

遺伝子発現解析により MoA(作用機序)や内在する毒性を示唆する

発生毒性に関するGSEAデータセットを持っていることが特徴。

​その他、MoAなどのデータセットも準備している。

ゼブラフィッシュの発生毒性の予測例

■ 検索パイプライン構築ツール
Workflow

標準メニューにない探索パイプラインが構築可能。

目的とするデータ収集を可能にする自動化処理。

繰り返し誰でも使える定型化。

データのアップデート時も再実行で更新。

ElpisMapで描画

化合物の部分構造と、複数のターゲットタンパク質を指定し、公共データから化合物の活性値と分子量をもとに、意思決定を行うツールElpis Mapで表示するパイプラインの例

詳細は専用ページへ
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