OmniTier CompStor® － NGS 2次・3次解析用システム
本製品は研究用途専用です
オンプレミスまたは
エッジ環境下のゲノム解析
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インターネット接続必要なし
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最高峰の診断率、より正確なバリアントコール
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解析にかかる全体費用の低減
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オンプレミスでの保管によるデータの完全な保護
CompStorは２次解析・３次解析と変異レポートを出力します
シーケンス
入力
Short Read - Illumina
Short Read - MGI
Long Read - PacBio
Long Read - ONT
FASTQ
uBAM
２次解析
VCF
BAM
３次解析
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患者レポート
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GWAS解析
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Privateデータベース作成
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可視化及びバイオマーカー探索
カタログダウンロード
Insight Oncology
カタログダウンロード
ライセンス形態
ハードウエア込み 永久ライセンス
他、お問合せください
新たにOncology３次解析が完成
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腫瘍原性分類
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AMP 分類
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Kataegis 解析
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腫瘍遺伝子変異量 (TMB)
Insight Oncology 三次解析 機能概要
腫瘍原性分類
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体細胞変異の病原性分類*に対応
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ユーザーによる個別のカテゴリを上書き ・ 修正し、最終評価を再計算が可能
* Peter Horak et al. Standards for the Classification of Pathogenicity of Somatic Variants in Cancer (Oncogenicity): Joint Recommendations of Clinical Genome Resource (ClinGen), Cancer Genomics Consortium (CGC), and Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
AMP分類
バリアントを次の カテゴリに分類します*
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Tier1A: FDA 承認の治療法が専門のガイドラインに含まれている
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Tier1B: 当該分野の専門家のコンセンサスがある十分に有力な研究がある
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Tier2C: 異なる腫瘍タイプに対する FDA 承認の治療法または治験中の治療法
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Tier2D:前臨床試験段階 または 少数の コンセンサスのない症例報告のみ
* Marilyn M. Li et al. Standards and Guidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer: A Joint Consensus Recommendation of the Association for Molecular Pathology, American Society of Clinical Oncology, and College of American Pathologists
Kataegis 解析
Kataegis 解析は、一部のがんゲノムで知られる局所的な高頻度変異のパターンをユーザーが発見することが可能
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がんの種類またはサブタイプを特定を支援
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予後のマーカーとしても機能し、治療の選択を支援
腫瘍遺伝子変異量解析
Tumor Mutation Burden
腫瘍遺伝子変異量 (TMB) とその臨床的意義
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腫瘍検体 DNA 内の体細胞変異の数を測定します。
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TMB が高いと、特定の免疫療法に対する反応が良くなります。
2つの方法で TMB を計算
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TMB 遺伝子コード領域: 腫瘍サンプルの遺伝子コード領域のすべての体細胞変異をTMB計算に含めます。
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TMB 非同義変異: 腫瘍サンプルの非同義（アミノ酸変化を伴う）体細胞変異のみをTMB計算に含めます
変異シグネチャ解析
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解析対象のサンプルについて、新規の変異シグネチャが抽出
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抽出されたシグネチャは、COSMIC データベース 1 内で既知のシグネチャに対応付け
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各シグネチャの変異プロファイルからは、考えられる病因や組織分布データなどの情報取得
Insight Oncology 解析パイプライン
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多彩なアノテーションデータベースで高度なアノテーション
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OMIM, Cosmicはカスタムデータベースとして利用可能
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その他、カスタムデータベースに対応可能
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オプションでファーマコゲノミクスやRNA解析が可能
従来の遺伝病解析機能も充実
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機械学習モデルで変異の優先付け
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AACMG 偶発的所見
Insight Hereditary: 三次解析 機能概要
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多彩なアノテーションデータベースで高度なアノテーション
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OMIM, Cosmicはカスタムデータベースとして利用可能
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その他、カスタムデータベースに対応可能
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オプションでファーマコゲノミクスやRNA解析が可能
ラインナップ
CompStor® Personal
デスクトップタイプ
小規模解析 マルチオミックス基礎研究を目的別サポート
基礎研究・ProやWorkgroup導入に向けた条件検討など
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デスクトップベースのタワー型ワークステーション
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シングルユーザー
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手動で解析を実行できるように設計・基礎研究や条件検討に最適
CompStor® Pro / Workgroup
ラックサーバータイプ データセンターでも設置に可能
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複数グループ・複数ユーザーで利用可
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自動化されたワークフロープロセスを実行
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他のネットワークシステムと統合可能
■ １台で２次解析と３次解析が両方できるオールインワンシステム
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CompStor SpectrumTM Pro
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CompStor SpectrumTM Workgroup
■ ２次解析と３次解析を独立サーバーで行うエンタープライズシステム
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CompStor Novos® Pro（２次解析用）
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CompStor Insight® Pro（３次解析用）
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CompStor Insight® Workgroup（３次解析用）
